Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XRCC4Q13426 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
XRCC4Q13426 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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