Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PMS2P3Q13401 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PMS2P3Q13401 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms