Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SKP2Q13309 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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SKP2Q13309 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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SKP2Q13309 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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SKP2Q13309 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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SKP2Q13309 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SKP2Q13309 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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