Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLN3Q13286 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLN3Q13286 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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