Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF6Q13247 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF6Q13247 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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