Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
MAP3K1Q13233 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
MAP3K1Q13233 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
MAP3K1Q13233 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
MAP3K1Q13233 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
MAP3K1Q13233 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
MAP3K1Q13233 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
MAP3K1Q13233 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
MAP3K1Q13233 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
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