Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEMA3BQ13214 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3BQ13214 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3BQ13214 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms