Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRPL28Q13084 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MRPL28Q13084 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MRPL28Q13084 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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