Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PRDM2Q13029 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC39.63■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
PRDM2Q13029 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
PRDM2Q13029 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
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