Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP1Q12981 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP1Q12981 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms