Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMAN2Q12907 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMAN2Q12907 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMAN2Q12907 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms