Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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RAB40BQ12829 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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RAB40BQ12829 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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RAB40BQ12829 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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RAB40BQ12829 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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RAB40BQ12829 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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RAB40BQ12829 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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RAB40BQ12829 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB40BQ12829 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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RAB40BQ12829 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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RAB40BQ12829 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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RAB40BQ12829 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB40BQ12829 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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