Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 STE12YHR084W 2067 nt5.92□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 TBF1YPL128C 1689 nt5.92□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 EXO1YOR033C 2109 nt5.92□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 YPT32YGL210W 669 nt5.92□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 YML101C-AYML101C-A 318 nt5.92□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 CKA2YOR061W 1020 nt5.92□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 UBS1YBR165W 834 nt5.92□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 STD1YOR047C 1335 nt5.92□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 ARB1YER036C 1833 nt5.92□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 RIM101YHL027W 1878 nt5.92□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 SMF3YLR034C 1422 nt5.91□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 SEC12YNR026C 1416 nt5.91□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 STE20YHL007C 2820 nt5.91□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 HAP1YLR256W 4509 nt5.91□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 CWC21YDR482C 408 nt5.91□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 GRX4YER174C 735 nt5.91□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 SKI6YGR195W 741 nt5.91□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 YJR085CYJR085C 318 nt5.91□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 YKR104WYKR104W 921 nt5.91□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 TOM40YMR203W 1164 nt5.91□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 KIP2YPL155C 2121 nt5.91□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 YPR098CYPR098C 486 nt5.91□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 WTM2YOR229W 1404 nt5.91□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 FOL1YNL256W 2475 nt5.9□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 GLO2YDR272W 825 nt5.9□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 RRP45YDR280W 918 nt5.9□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 CTR3YLR411W 726 nt5.9□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 ECM33YBR078W 1290 nt5.9□□□□□ -1.46
CLF1Q12309 IML2YJL082W 2196 nt5.9□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 GAS3YMR215W 1575 nt5.89□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 AAD6YFL056C 639 nt5.89□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt5.89□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 LEM3YNL323W 1245 nt5.89□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 YOL050CYOL050C 321 nt5.89□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 SER1YOR184W 1188 nt5.89□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 YOR292CYOR292C 930 nt5.89□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 MRL1YPR079W 1146 nt5.89□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.89□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 YMD8YML038C 1329 nt5.89□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 UBA2YDR390C 1911 nt5.89□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 PDH1YPR002W 1551 nt5.89□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 DCC1YCL016C 1143 nt5.88□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 QDR1YIL120W 1692 nt5.88□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 HXT3YDR345C 1704 nt5.88□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 GIP1YBR045C 1920 nt5.87□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 PSR1YLL010C 1284 nt5.87□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 BUD28YLR062C 378 nt5.87□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 GTR1YML121W 933 nt5.87□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 PRE7YBL041W 726 nt5.87□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 PFA4YOL003C 1137 nt5.87□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt5.87□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 ARO9YHR137W 1542 nt5.87□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 APL6YGR261C 2430 nt5.86□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 MNN2YBR015C 1794 nt5.86□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 TRP3YKL211C 1455 nt5.86□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 NEM1YHR004C 1341 nt5.86□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 YDR134CYDR134C 411 nt5.86□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 YEL028WYEL028W 462 nt5.86□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 YLF2YHL014C 1218 nt5.86□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 DBP8YHR169W 1296 nt5.86□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 GPI2YPL076W 843 nt5.86□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 YDC1YPL087W 954 nt5.86□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 AVT3YKL146W 2079 nt5.86□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 GCR2YNL199C 1605 nt5.85□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 APJ1YNL077W 1587 nt5.85□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 PEX19YDL065C 1029 nt5.85□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 MND2YIR025W 1107 nt5.85□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 YJL193WYJL193W 1209 nt5.85□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 YLR198CYLR198C 360 nt5.85□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 YLR402WYLR402W 192 nt5.85□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 GAL10YBR019C 2100 nt5.85□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 YPL014WYPL014W 1146 nt5.85□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 MIF2YKL089W 1650 nt5.85□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 GIP2YER054C 1647 nt5.85□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 DBF4YDR052C 2115 nt5.84□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 CLA4YNL298W 2529 nt5.84□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 RFA1YAR007C 1866 nt5.84□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 RPS16BYDL083C 432 nt5.84□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 RSM10YDR041W 612 nt5.84□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 AI3Q0060 1248 nt5.84□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 YDR161WYDR161W 1164 nt5.84□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 UTR4YEL038W 684 nt5.84□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 MRP13YGR084C 1020 nt5.84□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 FSH1YHR049W 732 nt5.84□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 NEJ1YLR265C 1029 nt5.84□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 MFA2YNL145W 117 nt5.84□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 SCO1YBR037C 888 nt5.84□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 BRF1YGR246C 1791 nt5.84□□□□□ -1.47
CLF1Q12309 UBC6YER100W 753 nt5.83□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 DUO1YGL061C 744 nt5.83□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YHL045WYHL045W 348 nt5.83□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YNL319WYNL319W 441 nt5.83□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt5.83□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 BAG7YOR134W 1230 nt5.83□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 HFI1YPL254W 1467 nt5.83□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 RGT1YKL038W 3513 nt5.82□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 NFI1YOR156C 2181 nt5.82□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 VCX1YDL128W 1236 nt5.82□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YER138W-AYER138W-A 105 nt5.82□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 FMP48YGR052W 1110 nt5.82□□□□□ -1.48
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