Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CPSF1Q10570 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
CPSF1Q10570 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CPSF1Q10570 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
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