Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD47Q08722 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD47Q08722 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD47Q08722 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD47Q08722 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD47Q08722 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD47Q08722 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD47Q08722 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD47Q08722 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD47Q08722 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD47Q08722 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD47Q08722 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD47Q08722 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD47Q08722 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD47Q08722 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD47Q08722 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD47Q08722 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD47Q08722 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD47Q08722 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD47Q08722 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD47Q08722 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD47Q08722 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD47Q08722 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD47Q08722 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CD47Q08722 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD47Q08722 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD47Q08722 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD47Q08722 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD47Q08722 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD47Q08722 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CD47Q08722 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD47Q08722 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD47Q08722 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD47Q08722 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD47Q08722 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CD47Q08722 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD47Q08722 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD47Q08722 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD47Q08722 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CD47Q08722 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD47Q08722 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD47Q08722 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD47Q08722 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD47Q08722 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD47Q08722 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CD47Q08722 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD47Q08722 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD47Q08722 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD47Q08722 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD47Q08722 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD47Q08722 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD47Q08722 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD47Q08722 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD47Q08722 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD47Q08722 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD47Q08722 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD47Q08722 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD47Q08722 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CD47Q08722 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD47Q08722 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD47Q08722 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD47Q08722 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD47Q08722 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD47Q08722 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD47Q08722 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD47Q08722 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD47Q08722 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD47Q08722 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD47Q08722 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD47Q08722 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD47Q08722 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD47Q08722 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD47Q08722 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD47Q08722 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD47Q08722 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD47Q08722 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD47Q08722 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD47Q08722 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD47Q08722 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD47Q08722 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD47Q08722 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD47Q08722 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD47Q08722 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CD47Q08722 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CD47Q08722 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms