Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DHX9Q08211 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DHX9Q08211 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms