Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRP1Q07954 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LRP1Q07954 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms