Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP4Q07065 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CKAP4Q07065 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms