Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHRNDQ07001 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CHRNDQ07001 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNDQ07001 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms