Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDSRQ06136 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDSRQ06136 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDSRQ06136 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDSRQ06136 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDSRQ06136 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDSRQ06136 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KDSRQ06136 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDSRQ06136 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDSRQ06136 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDSRQ06136 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDSRQ06136 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KDSRQ06136 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDSRQ06136 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms