Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRNB3Q05901 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHRNB3Q05901 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms