Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKCDQ05655 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRKCDQ05655 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms