Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD164Q04900 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD164Q04900 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD164Q04900 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD164Q04900 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD164Q04900 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD164Q04900 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD164Q04900 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD164Q04900 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD164Q04900 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD164Q04900 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD164Q04900 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD164Q04900 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD164Q04900 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD164Q04900 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD164Q04900 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CD164Q04900 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CD164Q04900 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD164Q04900 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD164Q04900 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD164Q04900 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD164Q04900 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CD164Q04900 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD164Q04900 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD164Q04900 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD164Q04900 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD164Q04900 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD164Q04900 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD164Q04900 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD164Q04900 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD164Q04900 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD164Q04900 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD164Q04900 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD164Q04900 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD164Q04900 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD164Q04900 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD164Q04900 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD164Q04900 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD164Q04900 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD164Q04900 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD164Q04900 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD164Q04900 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD164Q04900 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD164Q04900 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD164Q04900 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD164Q04900 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD164Q04900 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD164Q04900 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD164Q04900 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD164Q04900 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD164Q04900 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD164Q04900 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD164Q04900 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD164Q04900 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD164Q04900 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD164Q04900 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD164Q04900 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CD164Q04900 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms