Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACVR1Q04771 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACVR1Q04771 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACVR1Q04771 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACVR1Q04771 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ACVR1Q04771 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACVR1Q04771 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACVR1Q04771 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACVR1Q04771 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACVR1Q04771 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACVR1Q04771 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ACVR1Q04771 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1Q04771 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms