Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CENPCQ03188 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CENPCQ03188 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CENPCQ03188 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms