Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAV1Q03135 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAV1Q03135 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAV1Q03135 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms