Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GCNT1Q02742 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GCNT1Q02742 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms