Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDR2Q01850 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDR2Q01850 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms