Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFITM3Q01628 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms