Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDPQ00604 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NDPQ00604 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NDPQ00604 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDPQ00604 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDPQ00604 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDPQ00604 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDPQ00604 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDPQ00604 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDPQ00604 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDPQ00604 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDPQ00604 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDPQ00604 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NDPQ00604 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDPQ00604 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDPQ00604 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDPQ00604 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDPQ00604 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDPQ00604 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDPQ00604 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NDPQ00604 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDPQ00604 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDPQ00604 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDPQ00604 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDPQ00604 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDPQ00604 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDPQ00604 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDPQ00604 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDPQ00604 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDPQ00604 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDPQ00604 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDPQ00604 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDPQ00604 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDPQ00604 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NDPQ00604 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDPQ00604 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDPQ00604 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDPQ00604 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDPQ00604 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDPQ00604 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDPQ00604 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDPQ00604 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDPQ00604 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDPQ00604 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDPQ00604 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDPQ00604 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDPQ00604 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDPQ00604 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDPQ00604 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDPQ00604 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDPQ00604 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDPQ00604 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NDPQ00604 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDPQ00604 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDPQ00604 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NDPQ00604 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDPQ00604 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDPQ00604 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDPQ00604 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NDPQ00604 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDPQ00604 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDPQ00604 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDPQ00604 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDPQ00604 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDPQ00604 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDPQ00604 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NDPQ00604 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDPQ00604 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NDPQ00604 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDPQ00604 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDPQ00604 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDPQ00604 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDPQ00604 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NDPQ00604 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms