Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2P78314 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2P78314 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms