Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL38P63173 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL38P63173 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL38P63173 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL38P63173 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL38P63173 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL38P63173 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL38P63173 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL38P63173 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL38P63173 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL38P63173 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL38P63173 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL38P63173 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL38P63173 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL38P63173 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL38P63173 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL38P63173 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL38P63173 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL38P63173 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL38P63173 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL38P63173 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL38P63173 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL38P63173 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL38P63173 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL38P63173 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL38P63173 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL38P63173 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL38P63173 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL38P63173 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL38P63173 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL38P63173 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL38P63173 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL38P63173 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL38P63173 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL38P63173 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL38P63173 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL38P63173 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL38P63173 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL38P63173 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL38P63173 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL38P63173 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL38P63173 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL38P63173 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPL38P63173 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL38P63173 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL38P63173 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL38P63173 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL38P63173 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL38P63173 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL38P63173 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL38P63173 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL38P63173 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL38P63173 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL38P63173 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL38P63173 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL38P63173 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL38P63173 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL38P63173 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL38P63173 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL38P63173 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL38P63173 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL38P63173 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL38P63173 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL38P63173 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL38P63173 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL38P63173 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL38P63173 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL38P63173 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL38P63173 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL38P63173 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL38P63173 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL38P63173 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL38P63173 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL38P63173 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL38P63173 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL38P63173 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL38P63173 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL38P63173 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL38P63173 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL38P63173 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL38P63173 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL38P63173 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL38P63173 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL38P63173 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL38P63173 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL38P63173 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL38P63173 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL38P63173 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL38P63173 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL38P63173 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL38P63173 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL38P63173 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL38P63173 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL38P63173 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL38P63173 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL38P63173 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL38P63173 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL38P63173 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL38P63173 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL38P63173 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms