Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAP1AP62834 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAP1AP62834 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAP1AP62834 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAP1AP62834 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAP1AP62834 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAP1AP62834 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAP1AP62834 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAP1AP62834 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAP1AP62834 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAP1AP62834 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAP1AP62834 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAP1AP62834 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAP1AP62834 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAP1AP62834 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAP1AP62834 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAP1AP62834 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms