Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S1P61966 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S1P61966 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms