Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P61574 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms