Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FXYD4P59646 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FXYD4P59646 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms