Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA1P56199 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA1P56199 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA1P56199 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms