Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPTEP56180 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPTEP56180 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPTEP56180 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPTEP56180 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPTEP56180 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPTEP56180 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPTEP56180 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPTEP56180 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPTEP56180 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPTEP56180 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms