Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPTEP56180 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPTEP56180 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPTEP56180 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TPTEP56180 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPTEP56180 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPTEP56180 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPTEP56180 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TPTEP56180 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPTEP56180 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPTEP56180 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TPTEP56180 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPTEP56180 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPTEP56180 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPTEP56180 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPTEP56180 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPTEP56180 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPTEP56180 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms