Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP9P55211 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP9P55211 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP9P55211 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP9P55211 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP9P55211 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP9P55211 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP9P55211 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP9P55211 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP9P55211 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CASP9P55211 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP9P55211 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP9P55211 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP9P55211 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP9P55211 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP9P55211 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP9P55211 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP9P55211 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP9P55211 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP9P55211 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP9P55211 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP9P55211 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP9P55211 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CASP9P55211 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CASP9P55211 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP9P55211 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP9P55211 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP9P55211 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP9P55211 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP9P55211 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP9P55211 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP9P55211 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP9P55211 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP9P55211 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP9P55211 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP9P55211 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP9P55211 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CASP9P55211 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP9P55211 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP9P55211 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP9P55211 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP9P55211 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP9P55211 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP9P55211 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP9P55211 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP9P55211 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP9P55211 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CASP9P55211 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP9P55211 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP9P55211 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP9P55211 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP9P55211 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP9P55211 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP9P55211 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP9P55211 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP9P55211 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP9P55211 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP9P55211 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CASP9P55211 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP9P55211 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP9P55211 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP9P55211 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP9P55211 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP9P55211 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP9P55211 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP9P55211 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP9P55211 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP9P55211 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP9P55211 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP9P55211 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP9P55211 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP9P55211 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP9P55211 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CASP9P55211 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP9P55211 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP9P55211 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP9P55211 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP9P55211 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP9P55211 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP9P55211 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP9P55211 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms