Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC12A3P55017 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC12A3P55017 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms