Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P54278 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P54278 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P54278 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P54278 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P54278 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P54278 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P54278 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P54278 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P54278 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P54278 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P54278 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P54278 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P54278 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P54278 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PMS2P54278 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P54278 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P54278 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P54278 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P54278 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P54278 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P54278 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P54278 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P54278 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P54278 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P54278 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P54278 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMS2P54278 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P54278 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P54278 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P54278 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P54278 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P54278 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P54278 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P54278 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P54278 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PMS2P54278 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P54278 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P54278 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P54278 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P54278 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P54278 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P54278 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMS2P54278 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P54278 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P54278 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P54278 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P54278 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P54278 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P54278 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P54278 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P54278 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMS2P54278 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P54278 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P54278 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P54278 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P54278 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P54278 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P54278 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P54278 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P54278 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P54278 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P54278 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P54278 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P54278 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PMS2P54278 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P54278 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P54278 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P54278 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P54278 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P54278 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P54278 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P54278 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P54278 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMS2P54278 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P54278 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P54278 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P54278 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P54278 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P54278 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P54278 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P54278 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P54278 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMS2P54278 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS2P54278 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS2P54278 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS2P54278 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS2P54278 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS2P54278 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS2P54278 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS2P54278 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS2P54278 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS2P54278 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMS2P54278 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PMS2P54278 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P54278 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P54278 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P54278 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P54278 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PMS2P54278 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms