Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATXN1P54253 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATXN1P54253 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATXN1P54253 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms