Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATXN3P54252 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN3P54252 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 388.3 ms