Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPAP53621 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPAP53621 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPAP53621 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPAP53621 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPAP53621 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPAP53621 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPAP53621 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPAP53621 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPAP53621 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPAP53621 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPAP53621 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPAP53621 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPAP53621 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPAP53621 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPAP53621 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPAP53621 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COPAP53621 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPAP53621 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPAP53621 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COPAP53621 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPAP53621 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPAP53621 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPAP53621 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPAP53621 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPAP53621 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPAP53621 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COPAP53621 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPAP53621 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPAP53621 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COPAP53621 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPAP53621 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COPAP53621 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPAP53621 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPAP53621 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPAP53621 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPAP53621 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPAP53621 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPAP53621 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPAP53621 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPAP53621 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPAP53621 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPAP53621 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COPAP53621 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPAP53621 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPAP53621 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPAP53621 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COPAP53621 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPAP53621 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPAP53621 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPAP53621 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPAP53621 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COPAP53621 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPAP53621 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPAP53621 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPAP53621 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPAP53621 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPAP53621 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COPAP53621 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
COPAP53621 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPAP53621 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPAP53621 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPAP53621 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPAP53621 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPAP53621 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPAP53621 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPAP53621 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPAP53621 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPAP53621 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPAP53621 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COPAP53621 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPAP53621 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPAP53621 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPAP53621 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPAP53621 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPAP53621 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPAP53621 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPAP53621 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPAP53621 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COPAP53621 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPAP53621 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPAP53621 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPAP53621 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPAP53621 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COPAP53621 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPAP53621 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPAP53621 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPAP53621 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPAP53621 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COPAP53621 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPAP53621 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPAP53621 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPAP53621 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COPAP53621 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPAP53621 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPAP53621 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPAP53621 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPAP53621 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPAP53621 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COPAP53621 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms