Protein–RNA interactions for Protein: P53041

PPP5C, Serine/threonine-protein phosphatase 5, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5CP53041 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPP5CP53041 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPP5CP53041 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms