Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK2P51955 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK2P51955 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK2P51955 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK2P51955 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK2P51955 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK2P51955 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK2P51955 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK2P51955 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK2P51955 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK2P51955 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK2P51955 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK2P51955 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK2P51955 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK2P51955 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK2P51955 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK2P51955 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK2P51955 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEK2P51955 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEK2P51955 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEK2P51955 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK2P51955 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK2P51955 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK2P51955 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK2P51955 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK2P51955 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK2P51955 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK2P51955 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK2P51955 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK2P51955 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK2P51955 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK2P51955 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEK2P51955 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK2P51955 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK2P51955 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK2P51955 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK2P51955 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK2P51955 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK2P51955 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK2P51955 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK2P51955 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK2P51955 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK2P51955 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEK2P51955 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK2P51955 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK2P51955 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK2P51955 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK2P51955 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK2P51955 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK2P51955 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEK2P51955 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK2P51955 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK2P51955 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK2P51955 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK2P51955 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK2P51955 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK2P51955 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK2P51955 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK2P51955 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK2P51955 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK2P51955 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK2P51955 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK2P51955 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK2P51955 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK2P51955 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK2P51955 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK2P51955 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK2P51955 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK2P51955 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms