Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK7P50613 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK7P50613 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK7P50613 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK7P50613 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK7P50613 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK7P50613 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK7P50613 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK7P50613 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK7P50613 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK7P50613 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK7P50613 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK7P50613 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK7P50613 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK7P50613 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK7P50613 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK7P50613 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK7P50613 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK7P50613 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK7P50613 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK7P50613 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK7P50613 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK7P50613 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK7P50613 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK7P50613 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK7P50613 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK7P50613 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK7P50613 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK7P50613 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK7P50613 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK7P50613 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK7P50613 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK7P50613 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK7P50613 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK7P50613 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK7P50613 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK7P50613 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK7P50613 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK7P50613 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK7P50613 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK7P50613 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK7P50613 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK7P50613 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK7P50613 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK7P50613 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK7P50613 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK7P50613 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK7P50613 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK7P50613 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK7P50613 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK7P50613 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK7P50613 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK7P50613 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK7P50613 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK7P50613 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK7P50613 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK7P50613 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK7P50613 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK7P50613 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK7P50613 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK7P50613 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK7P50613 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK7P50613 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK7P50613 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK7P50613 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK7P50613 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK7P50613 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK7P50613 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK7P50613 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK7P50613 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK7P50613 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK7P50613 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK7P50613 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK7P50613 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK7P50613 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK7P50613 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK7P50613 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK7P50613 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK7P50613 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK7P50613 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK7P50613 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK7P50613 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK7P50613 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK7P50613 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK7P50613 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms