Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRIP1P50238 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP1P50238 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms