Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF6P49848 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF6P49848 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF6P49848 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF6P49848 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF6P49848 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF6P49848 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF6P49848 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF6P49848 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF6P49848 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF6P49848 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF6P49848 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF6P49848 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF6P49848 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF6P49848 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF6P49848 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF6P49848 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF6P49848 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF6P49848 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF6P49848 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF6P49848 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF6P49848 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF6P49848 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF6P49848 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF6P49848 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF6P49848 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF6P49848 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF6P49848 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF6P49848 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF6P49848 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF6P49848 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF6P49848 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF6P49848 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF6P49848 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAF6P49848 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF6P49848 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF6P49848 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF6P49848 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF6P49848 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF6P49848 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF6P49848 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF6P49848 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF6P49848 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF6P49848 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAF6P49848 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF6P49848 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF6P49848 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF6P49848 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF6P49848 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF6P49848 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF6P49848 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAF6P49848 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF6P49848 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF6P49848 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF6P49848 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF6P49848 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF6P49848 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAF6P49848 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF6P49848 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF6P49848 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF6P49848 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF6P49848 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF6P49848 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF6P49848 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF6P49848 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF6P49848 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF6P49848 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF6P49848 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF6P49848 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF6P49848 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF6P49848 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAF6P49848 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF6P49848 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF6P49848 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF6P49848 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF6P49848 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF6P49848 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF6P49848 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF6P49848 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF6P49848 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF6P49848 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF6P49848 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms