Protein–RNA interactions for Protein: P49821

NDUFV1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV1P49821 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFV1P49821 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFV1P49821 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NDUFV1P49821 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NDUFV1P49821 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFV1P49821 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFV1P49821 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFV1P49821 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFV1P49821 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFV1P49821 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFV1P49821 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFV1P49821 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFV1P49821 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFV1P49821 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms